Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms