Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVW2

RLIM, E3 ubiquitin-protein ligase RLIM, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLIMQ9NVW2 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RLIMQ9NVW2 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms