Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSU2

TREX1, Three-prime repair exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX1Q9NSU2 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TREX1Q9NSU2 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TREX1Q9NSU2 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TREX1Q9NSU2 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TREX1Q9NSU2 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TREX1Q9NSU2 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TREX1Q9NSU2 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TREX1Q9NSU2 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TREX1Q9NSU2 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TREX1Q9NSU2 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TREX1Q9NSU2 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TREX1Q9NSU2 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TREX1Q9NSU2 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TREX1Q9NSU2 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TREX1Q9NSU2 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TREX1Q9NSU2 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TREX1Q9NSU2 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TREX1Q9NSU2 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TREX1Q9NSU2 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TREX1Q9NSU2 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TREX1Q9NSU2 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TREX1Q9NSU2 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TREX1Q9NSU2 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TREX1Q9NSU2 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TREX1Q9NSU2 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TREX1Q9NSU2 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TREX1Q9NSU2 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TREX1Q9NSU2 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TREX1Q9NSU2 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TREX1Q9NSU2 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TREX1Q9NSU2 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TREX1Q9NSU2 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TREX1Q9NSU2 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TREX1Q9NSU2 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TREX1Q9NSU2 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TREX1Q9NSU2 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TREX1Q9NSU2 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TREX1Q9NSU2 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TREX1Q9NSU2 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TREX1Q9NSU2 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TREX1Q9NSU2 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TREX1Q9NSU2 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TREX1Q9NSU2 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TREX1Q9NSU2 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TREX1Q9NSU2 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TREX1Q9NSU2 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TREX1Q9NSU2 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TREX1Q9NSU2 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TREX1Q9NSU2 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TREX1Q9NSU2 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TREX1Q9NSU2 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TREX1Q9NSU2 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TREX1Q9NSU2 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TREX1Q9NSU2 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TREX1Q9NSU2 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TREX1Q9NSU2 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TREX1Q9NSU2 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TREX1Q9NSU2 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TREX1Q9NSU2 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TREX1Q9NSU2 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TREX1Q9NSU2 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TREX1Q9NSU2 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms