Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms