Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR5

UBQLN4, Ubiquilin-4, humanhuman

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Length 601 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN4Q9NRR5 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
UBQLN4Q9NRR5 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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