Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF8

CTPS2, CTP synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS2Q9NRF8 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms