Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ40

SLC52A3, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 3, humanhuman

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Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A3Q9NQ40 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC52A3Q9NQ40 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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