Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ95

NSD3, Histone-lysine N-methyltransferase NSD3, humanhuman

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD3Q9BZ95 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSD3Q9BZ95 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSD3Q9BZ95 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSD3Q9BZ95 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSD3Q9BZ95 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSD3Q9BZ95 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSD3Q9BZ95 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSD3Q9BZ95 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSD3Q9BZ95 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSD3Q9BZ95 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSD3Q9BZ95 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSD3Q9BZ95 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSD3Q9BZ95 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSD3Q9BZ95 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSD3Q9BZ95 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NSD3Q9BZ95 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSD3Q9BZ95 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NSD3Q9BZ95 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSD3Q9BZ95 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSD3Q9BZ95 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSD3Q9BZ95 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSD3Q9BZ95 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NSD3Q9BZ95 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NSD3Q9BZ95 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NSD3Q9BZ95 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NSD3Q9BZ95 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NSD3Q9BZ95 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NSD3Q9BZ95 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NSD3Q9BZ95 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NSD3Q9BZ95 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NSD3Q9BZ95 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NSD3Q9BZ95 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NSD3Q9BZ95 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NSD3Q9BZ95 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NSD3Q9BZ95 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NSD3Q9BZ95 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NSD3Q9BZ95 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NSD3Q9BZ95 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NSD3Q9BZ95 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NSD3Q9BZ95 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NSD3Q9BZ95 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NSD3Q9BZ95 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NSD3Q9BZ95 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms