Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SRRTQ9BXP5 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SRRTQ9BXP5 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SRRTQ9BXP5 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SRRTQ9BXP5 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SRRTQ9BXP5 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SRRTQ9BXP5 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SRRTQ9BXP5 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SRRTQ9BXP5 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SRRTQ9BXP5 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SRRTQ9BXP5 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SRRTQ9BXP5 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SRRTQ9BXP5 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SRRTQ9BXP5 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SRRTQ9BXP5 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SRRTQ9BXP5 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SRRTQ9BXP5 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SRRTQ9BXP5 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SRRTQ9BXP5 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SRRTQ9BXP5 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SRRTQ9BXP5 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SRRTQ9BXP5 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SRRTQ9BXP5 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SRRTQ9BXP5 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SRRTQ9BXP5 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SRRTQ9BXP5 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SRRTQ9BXP5 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SRRTQ9BXP5 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SRRTQ9BXP5 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SRRTQ9BXP5 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SRRTQ9BXP5 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SRRTQ9BXP5 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SRRTQ9BXP5 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SRRTQ9BXP5 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SRRTQ9BXP5 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SRRTQ9BXP5 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SRRTQ9BXP5 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SRRTQ9BXP5 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SRRTQ9BXP5 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SRRTQ9BXP5 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SRRTQ9BXP5 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SRRTQ9BXP5 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SRRTQ9BXP5 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SRRTQ9BXP5 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SRRTQ9BXP5 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SRRTQ9BXP5 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SRRTQ9BXP5 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SRRTQ9BXP5 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SRRTQ9BXP5 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SRRTQ9BXP5 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SRRTQ9BXP5 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SRRTQ9BXP5 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SRRTQ9BXP5 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SRRTQ9BXP5 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SRRTQ9BXP5 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SRRTQ9BXP5 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SRRTQ9BXP5 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SRRTQ9BXP5 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SRRTQ9BXP5 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SRRTQ9BXP5 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SRRTQ9BXP5 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SRRTQ9BXP5 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SRRTQ9BXP5 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SRRTQ9BXP5 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SRRTQ9BXP5 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SRRTQ9BXP5 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SRRTQ9BXP5 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SRRTQ9BXP5 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SRRTQ9BXP5 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SRRTQ9BXP5 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SRRTQ9BXP5 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SRRTQ9BXP5 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SRRTQ9BXP5 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SRRTQ9BXP5 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SRRTQ9BXP5 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SRRTQ9BXP5 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SRRTQ9BXP5 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SRRTQ9BXP5 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SRRTQ9BXP5 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SRRTQ9BXP5 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SRRTQ9BXP5 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SRRTQ9BXP5 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SRRTQ9BXP5 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SRRTQ9BXP5 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SRRTQ9BXP5 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SRRTQ9BXP5 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SRRTQ9BXP5 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SRRTQ9BXP5 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SRRTQ9BXP5 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SRRTQ9BXP5 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SRRTQ9BXP5 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SRRTQ9BXP5 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SRRTQ9BXP5 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SRRTQ9BXP5 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SRRTQ9BXP5 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SRRTQ9BXP5 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SRRTQ9BXP5 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SRRTQ9BXP5 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SRRTQ9BXP5 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SRRTQ9BXP5 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
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