Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL7

CARD11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD11Q9BXL7 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CARD11Q9BXL7 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CARD11Q9BXL7 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CARD11Q9BXL7 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CARD11Q9BXL7 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CARD11Q9BXL7 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CARD11Q9BXL7 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CARD11Q9BXL7 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CARD11Q9BXL7 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CARD11Q9BXL7 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CARD11Q9BXL7 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CARD11Q9BXL7 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms