Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE2

TMEM79, Transmembrane protein 79, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM79Q9BSE2 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM79Q9BSE2 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM79Q9BSE2 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM79Q9BSE2 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM79Q9BSE2 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM79Q9BSE2 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM79Q9BSE2 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM79Q9BSE2 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM79Q9BSE2 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM79Q9BSE2 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM79Q9BSE2 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM79Q9BSE2 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM79Q9BSE2 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM79Q9BSE2 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM79Q9BSE2 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM79Q9BSE2 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM79Q9BSE2 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM79Q9BSE2 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM79Q9BSE2 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM79Q9BSE2 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM79Q9BSE2 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM79Q9BSE2 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM79Q9BSE2 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM79Q9BSE2 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM79Q9BSE2 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM79Q9BSE2 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM79Q9BSE2 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM79Q9BSE2 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM79Q9BSE2 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM79Q9BSE2 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM79Q9BSE2 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM79Q9BSE2 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM79Q9BSE2 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM79Q9BSE2 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM79Q9BSE2 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM79Q9BSE2 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM79Q9BSE2 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM79Q9BSE2 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM79Q9BSE2 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM79Q9BSE2 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM79Q9BSE2 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM79Q9BSE2 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM79Q9BSE2 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM79Q9BSE2 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM79Q9BSE2 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM79Q9BSE2 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM79Q9BSE2 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM79Q9BSE2 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM79Q9BSE2 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM79Q9BSE2 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM79Q9BSE2 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM79Q9BSE2 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM79Q9BSE2 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM79Q9BSE2 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM79Q9BSE2 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM79Q9BSE2 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM79Q9BSE2 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM79Q9BSE2 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM79Q9BSE2 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM79Q9BSE2 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM79Q9BSE2 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM79Q9BSE2 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM79Q9BSE2 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM79Q9BSE2 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM79Q9BSE2 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM79Q9BSE2 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM79Q9BSE2 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM79Q9BSE2 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM79Q9BSE2 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM79Q9BSE2 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM79Q9BSE2 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM79Q9BSE2 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM79Q9BSE2 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM79Q9BSE2 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM79Q9BSE2 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM79Q9BSE2 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM79Q9BSE2 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM79Q9BSE2 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM79Q9BSE2 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM79Q9BSE2 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM79Q9BSE2 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM79Q9BSE2 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM79Q9BSE2 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM79Q9BSE2 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM79Q9BSE2 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM79Q9BSE2 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM79Q9BSE2 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM79Q9BSE2 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM79Q9BSE2 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM79Q9BSE2 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM79Q9BSE2 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM79Q9BSE2 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM79Q9BSE2 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM79Q9BSE2 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM79Q9BSE2 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM79Q9BSE2 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM79Q9BSE2 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM79Q9BSE2 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM79Q9BSE2 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM79Q9BSE2 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms