Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms