Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms