Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms