Protein–RNA interactions for Protein: Q96RJ3

TNFRSF13C, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF13CQ96RJ3 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms