Protein–RNA interactions for Protein: Q96MU7

YTHDC1, YTH domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC1Q96MU7 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
YTHDC1Q96MU7 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms