Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms