Protein–RNA interactions for Protein: Q96JW4

SLC41A2, Solute carrier family 41 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC41A2Q96JW4 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms