Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY1

DNAJA3, DnaJ homolog subfamily A member 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA3Q96EY1 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJA3Q96EY1 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJA3Q96EY1 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJA3Q96EY1 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJA3Q96EY1 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJA3Q96EY1 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJA3Q96EY1 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJA3Q96EY1 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJA3Q96EY1 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJA3Q96EY1 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJA3Q96EY1 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJA3Q96EY1 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJA3Q96EY1 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJA3Q96EY1 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJA3Q96EY1 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJA3Q96EY1 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJA3Q96EY1 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJA3Q96EY1 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJA3Q96EY1 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJA3Q96EY1 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJA3Q96EY1 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJA3Q96EY1 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJA3Q96EY1 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAJA3Q96EY1 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJA3Q96EY1 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJA3Q96EY1 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJA3Q96EY1 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJA3Q96EY1 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJA3Q96EY1 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJA3Q96EY1 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJA3Q96EY1 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJA3Q96EY1 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJA3Q96EY1 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJA3Q96EY1 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJA3Q96EY1 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJA3Q96EY1 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJA3Q96EY1 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJA3Q96EY1 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJA3Q96EY1 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJA3Q96EY1 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJA3Q96EY1 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJA3Q96EY1 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJA3Q96EY1 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJA3Q96EY1 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJA3Q96EY1 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJA3Q96EY1 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJA3Q96EY1 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJA3Q96EY1 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJA3Q96EY1 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJA3Q96EY1 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJA3Q96EY1 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJA3Q96EY1 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJA3Q96EY1 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJA3Q96EY1 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJA3Q96EY1 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJA3Q96EY1 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJA3Q96EY1 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJA3Q96EY1 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJA3Q96EY1 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJA3Q96EY1 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJA3Q96EY1 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJA3Q96EY1 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJA3Q96EY1 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJA3Q96EY1 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJA3Q96EY1 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJA3Q96EY1 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJA3Q96EY1 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJA3Q96EY1 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJA3Q96EY1 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJA3Q96EY1 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJA3Q96EY1 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJA3Q96EY1 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJA3Q96EY1 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJA3Q96EY1 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNAJA3Q96EY1 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNAJA3Q96EY1 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNAJA3Q96EY1 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNAJA3Q96EY1 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNAJA3Q96EY1 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNAJA3Q96EY1 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNAJA3Q96EY1 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNAJA3Q96EY1 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNAJA3Q96EY1 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNAJA3Q96EY1 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNAJA3Q96EY1 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNAJA3Q96EY1 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNAJA3Q96EY1 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNAJA3Q96EY1 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNAJA3Q96EY1 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNAJA3Q96EY1 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNAJA3Q96EY1 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNAJA3Q96EY1 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNAJA3Q96EY1 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNAJA3Q96EY1 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNAJA3Q96EY1 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNAJA3Q96EY1 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNAJA3Q96EY1 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNAJA3Q96EY1 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNAJA3Q96EY1 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNAJA3Q96EY1 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms