Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms