Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC3

PYDC1, Pyrin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYDC1Q8WXC3 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PYDC1Q8WXC3 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PYDC1Q8WXC3 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PYDC1Q8WXC3 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PYDC1Q8WXC3 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PYDC1Q8WXC3 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms