Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA56

TTC29, Tetratricopeptide repeat protein 29, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC29Q8NA56 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTC29Q8NA56 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms