Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W8

FAM71D, Protein FAM71D, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71DQ8N9W8 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM71DQ8N9W8 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.5 ms