Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Y2

LRRC17, Leucine-rich repeat-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC17Q8N6Y2 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRC17Q8N6Y2 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms