Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00612Q8N6U2 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms