Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN19Q8N6F1 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN19Q8N6F1 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN19Q8N6F1 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN19Q8N6F1 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN19Q8N6F1 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN19Q8N6F1 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN19Q8N6F1 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN19Q8N6F1 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN19Q8N6F1 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN19Q8N6F1 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN19Q8N6F1 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN19Q8N6F1 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN19Q8N6F1 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN19Q8N6F1 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN19Q8N6F1 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN19Q8N6F1 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN19Q8N6F1 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN19Q8N6F1 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN19Q8N6F1 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN19Q8N6F1 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN19Q8N6F1 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN19Q8N6F1 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN19Q8N6F1 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLDN19Q8N6F1 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLDN19Q8N6F1 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLDN19Q8N6F1 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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CLDN19Q8N6F1 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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CLDN19Q8N6F1 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLDN19Q8N6F1 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLDN19Q8N6F1 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLDN19Q8N6F1 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLDN19Q8N6F1 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLDN19Q8N6F1 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLDN19Q8N6F1 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLDN19Q8N6F1 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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CLDN19Q8N6F1 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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CLDN19Q8N6F1 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLDN19Q8N6F1 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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CLDN19Q8N6F1 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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CLDN19Q8N6F1 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLDN19Q8N6F1 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLDN19Q8N6F1 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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CLDN19Q8N6F1 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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CLDN19Q8N6F1 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLDN19Q8N6F1 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLDN19Q8N6F1 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLDN19Q8N6F1 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLDN19Q8N6F1 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLDN19Q8N6F1 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLDN19Q8N6F1 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLDN19Q8N6F1 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLDN19Q8N6F1 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLDN19Q8N6F1 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLDN19Q8N6F1 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CLDN19Q8N6F1 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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