Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5D8

NANOGNB, NANOG neighbor homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGNBQ7Z5D8 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NANOGNBQ7Z5D8 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NANOGNBQ7Z5D8 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NANOGNBQ7Z5D8 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NANOGNBQ7Z5D8 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NANOGNBQ7Z5D8 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NANOGNBQ7Z5D8 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NANOGNBQ7Z5D8 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NANOGNBQ7Z5D8 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NANOGNBQ7Z5D8 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NANOGNBQ7Z5D8 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NANOGNBQ7Z5D8 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NANOGNBQ7Z5D8 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NANOGNBQ7Z5D8 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NANOGNBQ7Z5D8 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NANOGNBQ7Z5D8 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NANOGNBQ7Z5D8 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NANOGNBQ7Z5D8 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NANOGNBQ7Z5D8 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NANOGNBQ7Z5D8 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NANOGNBQ7Z5D8 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NANOGNBQ7Z5D8 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NANOGNBQ7Z5D8 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NANOGNBQ7Z5D8 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NANOGNBQ7Z5D8 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NANOGNBQ7Z5D8 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NANOGNBQ7Z5D8 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NANOGNBQ7Z5D8 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NANOGNBQ7Z5D8 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NANOGNBQ7Z5D8 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NANOGNBQ7Z5D8 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NANOGNBQ7Z5D8 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NANOGNBQ7Z5D8 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NANOGNBQ7Z5D8 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NANOGNBQ7Z5D8 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NANOGNBQ7Z5D8 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NANOGNBQ7Z5D8 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NANOGNBQ7Z5D8 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NANOGNBQ7Z5D8 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NANOGNBQ7Z5D8 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NANOGNBQ7Z5D8 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NANOGNBQ7Z5D8 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NANOGNBQ7Z5D8 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NANOGNBQ7Z5D8 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NANOGNBQ7Z5D8 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NANOGNBQ7Z5D8 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NANOGNBQ7Z5D8 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NANOGNBQ7Z5D8 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NANOGNBQ7Z5D8 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NANOGNBQ7Z5D8 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NANOGNBQ7Z5D8 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NANOGNBQ7Z5D8 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NANOGNBQ7Z5D8 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NANOGNBQ7Z5D8 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NANOGNBQ7Z5D8 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NANOGNBQ7Z5D8 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NANOGNBQ7Z5D8 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NANOGNBQ7Z5D8 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NANOGNBQ7Z5D8 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NANOGNBQ7Z5D8 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NANOGNBQ7Z5D8 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NANOGNBQ7Z5D8 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NANOGNBQ7Z5D8 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NANOGNBQ7Z5D8 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NANOGNBQ7Z5D8 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NANOGNBQ7Z5D8 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NANOGNBQ7Z5D8 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NANOGNBQ7Z5D8 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NANOGNBQ7Z5D8 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NANOGNBQ7Z5D8 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NANOGNBQ7Z5D8 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NANOGNBQ7Z5D8 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NANOGNBQ7Z5D8 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NANOGNBQ7Z5D8 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NANOGNBQ7Z5D8 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NANOGNBQ7Z5D8 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NANOGNBQ7Z5D8 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NANOGNBQ7Z5D8 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NANOGNBQ7Z5D8 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NANOGNBQ7Z5D8 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NANOGNBQ7Z5D8 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NANOGNBQ7Z5D8 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NANOGNBQ7Z5D8 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NANOGNBQ7Z5D8 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NANOGNBQ7Z5D8 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NANOGNBQ7Z5D8 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NANOGNBQ7Z5D8 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NANOGNBQ7Z5D8 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NANOGNBQ7Z5D8 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NANOGNBQ7Z5D8 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NANOGNBQ7Z5D8 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NANOGNBQ7Z5D8 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NANOGNBQ7Z5D8 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NANOGNBQ7Z5D8 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NANOGNBQ7Z5D8 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NANOGNBQ7Z5D8 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NANOGNBQ7Z5D8 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NANOGNBQ7Z5D8 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NANOGNBQ7Z5D8 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NANOGNBQ7Z5D8 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms