Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3C6

ATG9A, Autophagy-related protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9AQ7Z3C6 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG9AQ7Z3C6 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG9AQ7Z3C6 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG9AQ7Z3C6 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG9AQ7Z3C6 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG9AQ7Z3C6 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG9AQ7Z3C6 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG9AQ7Z3C6 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG9AQ7Z3C6 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG9AQ7Z3C6 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG9AQ7Z3C6 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG9AQ7Z3C6 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG9AQ7Z3C6 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG9AQ7Z3C6 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG9AQ7Z3C6 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG9AQ7Z3C6 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG9AQ7Z3C6 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG9AQ7Z3C6 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG9AQ7Z3C6 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG9AQ7Z3C6 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG9AQ7Z3C6 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG9AQ7Z3C6 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG9AQ7Z3C6 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG9AQ7Z3C6 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG9AQ7Z3C6 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG9AQ7Z3C6 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG9AQ7Z3C6 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG9AQ7Z3C6 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG9AQ7Z3C6 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG9AQ7Z3C6 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG9AQ7Z3C6 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG9AQ7Z3C6 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG9AQ7Z3C6 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG9AQ7Z3C6 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG9AQ7Z3C6 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG9AQ7Z3C6 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG9AQ7Z3C6 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG9AQ7Z3C6 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG9AQ7Z3C6 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG9AQ7Z3C6 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG9AQ7Z3C6 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG9AQ7Z3C6 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG9AQ7Z3C6 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG9AQ7Z3C6 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG9AQ7Z3C6 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG9AQ7Z3C6 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG9AQ7Z3C6 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG9AQ7Z3C6 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG9AQ7Z3C6 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG9AQ7Z3C6 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG9AQ7Z3C6 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG9AQ7Z3C6 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG9AQ7Z3C6 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG9AQ7Z3C6 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG9AQ7Z3C6 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG9AQ7Z3C6 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG9AQ7Z3C6 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG9AQ7Z3C6 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG9AQ7Z3C6 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG9AQ7Z3C6 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG9AQ7Z3C6 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG9AQ7Z3C6 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG9AQ7Z3C6 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG9AQ7Z3C6 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG9AQ7Z3C6 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG9AQ7Z3C6 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG9AQ7Z3C6 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG9AQ7Z3C6 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG9AQ7Z3C6 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG9AQ7Z3C6 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG9AQ7Z3C6 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG9AQ7Z3C6 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG9AQ7Z3C6 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG9AQ7Z3C6 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG9AQ7Z3C6 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG9AQ7Z3C6 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG9AQ7Z3C6 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG9AQ7Z3C6 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG9AQ7Z3C6 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG9AQ7Z3C6 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG9AQ7Z3C6 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG9AQ7Z3C6 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG9AQ7Z3C6 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG9AQ7Z3C6 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG9AQ7Z3C6 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG9AQ7Z3C6 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG9AQ7Z3C6 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG9AQ7Z3C6 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG9AQ7Z3C6 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG9AQ7Z3C6 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG9AQ7Z3C6 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG9AQ7Z3C6 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG9AQ7Z3C6 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG9AQ7Z3C6 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG9AQ7Z3C6 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG9AQ7Z3C6 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG9AQ7Z3C6 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG9AQ7Z3C6 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG9AQ7Z3C6 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG9AQ7Z3C6 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms