Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms