Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

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Length 3,546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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