Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY6

WDR88, WD repeat-containing protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR88Q6ZMY6 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms