Protein–RNA interactions for Protein: Q6Y1H2

HACD2, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 2, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD2Q6Y1H2 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms