Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC174Q6PII3 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC174Q6PII3 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC174Q6PII3 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC174Q6PII3 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC174Q6PII3 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC174Q6PII3 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC174Q6PII3 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC174Q6PII3 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC174Q6PII3 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC174Q6PII3 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC174Q6PII3 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC174Q6PII3 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC174Q6PII3 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC174Q6PII3 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC174Q6PII3 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC174Q6PII3 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC174Q6PII3 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC174Q6PII3 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC174Q6PII3 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC174Q6PII3 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC174Q6PII3 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC174Q6PII3 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC174Q6PII3 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC174Q6PII3 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC174Q6PII3 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC174Q6PII3 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC174Q6PII3 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC174Q6PII3 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC174Q6PII3 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC174Q6PII3 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC174Q6PII3 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC174Q6PII3 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC174Q6PII3 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC174Q6PII3 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC174Q6PII3 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC174Q6PII3 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC174Q6PII3 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC174Q6PII3 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC174Q6PII3 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC174Q6PII3 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC174Q6PII3 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC174Q6PII3 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC174Q6PII3 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC174Q6PII3 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC174Q6PII3 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC174Q6PII3 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC174Q6PII3 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC174Q6PII3 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC174Q6PII3 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC174Q6PII3 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC174Q6PII3 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC174Q6PII3 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC174Q6PII3 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC174Q6PII3 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC174Q6PII3 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC174Q6PII3 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC174Q6PII3 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC174Q6PII3 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC174Q6PII3 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC174Q6PII3 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC174Q6PII3 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC174Q6PII3 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC174Q6PII3 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC174Q6PII3 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC174Q6PII3 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC174Q6PII3 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC174Q6PII3 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC174Q6PII3 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC174Q6PII3 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC174Q6PII3 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC174Q6PII3 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC174Q6PII3 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC174Q6PII3 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC174Q6PII3 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC174Q6PII3 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC174Q6PII3 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC174Q6PII3 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC174Q6PII3 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC174Q6PII3 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC174Q6PII3 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC174Q6PII3 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC174Q6PII3 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC174Q6PII3 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC174Q6PII3 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC174Q6PII3 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC174Q6PII3 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC174Q6PII3 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC174Q6PII3 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC174Q6PII3 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC174Q6PII3 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC174Q6PII3 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC174Q6PII3 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC174Q6PII3 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC174Q6PII3 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC174Q6PII3 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC174Q6PII3 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC174Q6PII3 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC174Q6PII3 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC174Q6PII3 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms