Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4Q7

CNNM4, Metal transporter CNNM4, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM4Q6P4Q7 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CNNM4Q6P4Q7 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CNNM4Q6P4Q7 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
CNNM4Q6P4Q7 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CNNM4Q6P4Q7 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CNNM4Q6P4Q7 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNNM4Q6P4Q7 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNNM4Q6P4Q7 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNNM4Q6P4Q7 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNNM4Q6P4Q7 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNNM4Q6P4Q7 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CNNM4Q6P4Q7 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNNM4Q6P4Q7 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNNM4Q6P4Q7 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNNM4Q6P4Q7 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNNM4Q6P4Q7 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNNM4Q6P4Q7 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNNM4Q6P4Q7 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNNM4Q6P4Q7 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNNM4Q6P4Q7 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNNM4Q6P4Q7 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CNNM4Q6P4Q7 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNNM4Q6P4Q7 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CNNM4Q6P4Q7 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CNNM4Q6P4Q7 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNNM4Q6P4Q7 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNNM4Q6P4Q7 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CNNM4Q6P4Q7 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNNM4Q6P4Q7 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNNM4Q6P4Q7 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNNM4Q6P4Q7 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNNM4Q6P4Q7 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNNM4Q6P4Q7 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNNM4Q6P4Q7 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNNM4Q6P4Q7 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNNM4Q6P4Q7 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNNM4Q6P4Q7 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNNM4Q6P4Q7 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNNM4Q6P4Q7 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNNM4Q6P4Q7 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNNM4Q6P4Q7 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNNM4Q6P4Q7 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNNM4Q6P4Q7 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNNM4Q6P4Q7 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNNM4Q6P4Q7 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNNM4Q6P4Q7 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNNM4Q6P4Q7 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNNM4Q6P4Q7 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNNM4Q6P4Q7 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNNM4Q6P4Q7 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNNM4Q6P4Q7 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNNM4Q6P4Q7 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNNM4Q6P4Q7 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNNM4Q6P4Q7 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNNM4Q6P4Q7 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNNM4Q6P4Q7 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CNNM4Q6P4Q7 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNNM4Q6P4Q7 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNNM4Q6P4Q7 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNNM4Q6P4Q7 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNNM4Q6P4Q7 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNNM4Q6P4Q7 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNNM4Q6P4Q7 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNNM4Q6P4Q7 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNNM4Q6P4Q7 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNNM4Q6P4Q7 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNNM4Q6P4Q7 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNNM4Q6P4Q7 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNNM4Q6P4Q7 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNNM4Q6P4Q7 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CNNM4Q6P4Q7 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNNM4Q6P4Q7 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNNM4Q6P4Q7 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNNM4Q6P4Q7 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNNM4Q6P4Q7 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNNM4Q6P4Q7 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNNM4Q6P4Q7 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNNM4Q6P4Q7 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CNNM4Q6P4Q7 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNNM4Q6P4Q7 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNNM4Q6P4Q7 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNNM4Q6P4Q7 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNNM4Q6P4Q7 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNNM4Q6P4Q7 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNNM4Q6P4Q7 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNNM4Q6P4Q7 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNNM4Q6P4Q7 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNNM4Q6P4Q7 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNNM4Q6P4Q7 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNNM4Q6P4Q7 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNNM4Q6P4Q7 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNNM4Q6P4Q7 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNNM4Q6P4Q7 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNNM4Q6P4Q7 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNNM4Q6P4Q7 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNNM4Q6P4Q7 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNNM4Q6P4Q7 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNNM4Q6P4Q7 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNNM4Q6P4Q7 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNNM4Q6P4Q7 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms