Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYV7

SLX4IP, Protein SLX4IP, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4IPQ5VYV7 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms