Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6F2

UBAP2, Ubiquitin-associated protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP2Q5T6F2 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBAP2Q5T6F2 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBAP2Q5T6F2 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBAP2Q5T6F2 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBAP2Q5T6F2 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBAP2Q5T6F2 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBAP2Q5T6F2 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBAP2Q5T6F2 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBAP2Q5T6F2 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBAP2Q5T6F2 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBAP2Q5T6F2 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBAP2Q5T6F2 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBAP2Q5T6F2 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBAP2Q5T6F2 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
UBAP2Q5T6F2 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
UBAP2Q5T6F2 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBAP2Q5T6F2 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBAP2Q5T6F2 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBAP2Q5T6F2 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBAP2Q5T6F2 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBAP2Q5T6F2 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBAP2Q5T6F2 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBAP2Q5T6F2 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBAP2Q5T6F2 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBAP2Q5T6F2 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBAP2Q5T6F2 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBAP2Q5T6F2 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBAP2Q5T6F2 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBAP2Q5T6F2 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBAP2Q5T6F2 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBAP2Q5T6F2 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBAP2Q5T6F2 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBAP2Q5T6F2 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBAP2Q5T6F2 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
UBAP2Q5T6F2 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBAP2Q5T6F2 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBAP2Q5T6F2 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
UBAP2Q5T6F2 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBAP2Q5T6F2 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBAP2Q5T6F2 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBAP2Q5T6F2 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBAP2Q5T6F2 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBAP2Q5T6F2 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBAP2Q5T6F2 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBAP2Q5T6F2 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBAP2Q5T6F2 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBAP2Q5T6F2 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBAP2Q5T6F2 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBAP2Q5T6F2 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBAP2Q5T6F2 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBAP2Q5T6F2 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBAP2Q5T6F2 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBAP2Q5T6F2 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBAP2Q5T6F2 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
UBAP2Q5T6F2 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBAP2Q5T6F2 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBAP2Q5T6F2 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBAP2Q5T6F2 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBAP2Q5T6F2 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBAP2Q5T6F2 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
UBAP2Q5T6F2 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBAP2Q5T6F2 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBAP2Q5T6F2 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBAP2Q5T6F2 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBAP2Q5T6F2 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
UBAP2Q5T6F2 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBAP2Q5T6F2 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBAP2Q5T6F2 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
UBAP2Q5T6F2 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBAP2Q5T6F2 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBAP2Q5T6F2 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBAP2Q5T6F2 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBAP2Q5T6F2 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBAP2Q5T6F2 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBAP2Q5T6F2 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBAP2Q5T6F2 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBAP2Q5T6F2 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBAP2Q5T6F2 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms