Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJ08

SPANXN4, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome N4, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXN4Q5MJ08 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPANXN4Q5MJ08 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPANXN4Q5MJ08 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPANXN4Q5MJ08 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPANXN4Q5MJ08 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPANXN4Q5MJ08 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPANXN4Q5MJ08 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPANXN4Q5MJ08 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPANXN4Q5MJ08 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPANXN4Q5MJ08 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPANXN4Q5MJ08 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SPANXN4Q5MJ08 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SPANXN4Q5MJ08 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPANXN4Q5MJ08 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SPANXN4Q5MJ08 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SPANXN4Q5MJ08 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPANXN4Q5MJ08 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPANXN4Q5MJ08 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPANXN4Q5MJ08 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPANXN4Q5MJ08 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms