Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms