Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HSD17B12Q53GQ0 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms