Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.9 ms