Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

Predictions only

Length 58 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.7□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 AC103808.3-201ENST00000579714 598 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 OST4-201ENST00000429985 559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
KRTAP21-3Q3LHN1 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms