Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms