Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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FXNQ16595 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FXNQ16595 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FXNQ16595 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FXNQ16595 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FXNQ16595 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FXNQ16595 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FXNQ16595 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FXNQ16595 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FXNQ16595 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FXNQ16595 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
FXNQ16595 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
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FXNQ16595 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
FXNQ16595 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
FXNQ16595 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
FXNQ16595 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
FXNQ16595 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
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FXNQ16595 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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FXNQ16595 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FXNQ16595 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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FXNQ16595 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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FXNQ16595 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FXNQ16595 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FXNQ16595 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FXNQ16595 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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FXNQ16595 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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FXNQ16595 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FXNQ16595 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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FXNQ16595 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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FXNQ16595 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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FXNQ16595 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FXNQ16595 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FXNQ16595 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FXNQ16595 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FXNQ16595 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FXNQ16595 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FXNQ16595 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FXNQ16595 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FXNQ16595 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms