Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCSK7Q16549 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCSK7Q16549 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PCSK7Q16549 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCSK7Q16549 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCSK7Q16549 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCSK7Q16549 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCSK7Q16549 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCSK7Q16549 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCSK7Q16549 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PCSK7Q16549 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCSK7Q16549 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCSK7Q16549 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCSK7Q16549 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCSK7Q16549 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCSK7Q16549 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCSK7Q16549 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCSK7Q16549 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCSK7Q16549 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCSK7Q16549 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCSK7Q16549 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCSK7Q16549 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCSK7Q16549 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCSK7Q16549 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCSK7Q16549 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PCSK7Q16549 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCSK7Q16549 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCSK7Q16549 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCSK7Q16549 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCSK7Q16549 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCSK7Q16549 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCSK7Q16549 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCSK7Q16549 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCSK7Q16549 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCSK7Q16549 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCSK7Q16549 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCSK7Q16549 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCSK7Q16549 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCSK7Q16549 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCSK7Q16549 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCSK7Q16549 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCSK7Q16549 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCSK7Q16549 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCSK7Q16549 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCSK7Q16549 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PCSK7Q16549 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCSK7Q16549 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PCSK7Q16549 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCSK7Q16549 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PCSK7Q16549 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCSK7Q16549 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCSK7Q16549 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCSK7Q16549 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCSK7Q16549 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCSK7Q16549 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCSK7Q16549 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCSK7Q16549 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCSK7Q16549 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCSK7Q16549 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCSK7Q16549 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCSK7Q16549 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCSK7Q16549 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCSK7Q16549 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCSK7Q16549 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCSK7Q16549 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCSK7Q16549 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCSK7Q16549 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCSK7Q16549 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PCSK7Q16549 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCSK7Q16549 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCSK7Q16549 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCSK7Q16549 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCSK7Q16549 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCSK7Q16549 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCSK7Q16549 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PCSK7Q16549 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCSK7Q16549 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCSK7Q16549 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCSK7Q16549 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PCSK7Q16549 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCSK7Q16549 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCSK7Q16549 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCSK7Q16549 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCSK7Q16549 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCSK7Q16549 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCSK7Q16549 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCSK7Q16549 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCSK7Q16549 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCSK7Q16549 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCSK7Q16549 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PCSK7Q16549 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCSK7Q16549 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCSK7Q16549 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCSK7Q16549 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCSK7Q16549 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCSK7Q16549 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCSK7Q16549 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCSK7Q16549 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCSK7Q16549 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCSK7Q16549 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms