Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
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DDB1Q16531 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
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DDB1Q16531 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
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DDB1Q16531 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
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DDB1Q16531 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
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DDB1Q16531 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
DDB1Q16531 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DDB1Q16531 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
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