Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
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