Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNHIT3Q15649 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms