Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SS18Q15532 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SS18Q15532 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SS18Q15532 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SS18Q15532 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SS18Q15532 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SS18Q15532 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SS18Q15532 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SS18Q15532 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SS18Q15532 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SS18Q15532 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SS18Q15532 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SS18Q15532 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SS18Q15532 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SS18Q15532 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SS18Q15532 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SS18Q15532 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SS18Q15532 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SS18Q15532 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SS18Q15532 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SS18Q15532 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SS18Q15532 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SS18Q15532 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SS18Q15532 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SS18Q15532 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SS18Q15532 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SS18Q15532 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SS18Q15532 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SS18Q15532 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SS18Q15532 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SS18Q15532 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SS18Q15532 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SS18Q15532 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SS18Q15532 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SS18Q15532 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SS18Q15532 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SS18Q15532 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SS18Q15532 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SS18Q15532 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SS18Q15532 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SS18Q15532 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SS18Q15532 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SS18Q15532 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SS18Q15532 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SS18Q15532 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SS18Q15532 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SS18Q15532 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SS18Q15532 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SS18Q15532 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SS18Q15532 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SS18Q15532 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SS18Q15532 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SS18Q15532 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SS18Q15532 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SS18Q15532 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SS18Q15532 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SS18Q15532 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SS18Q15532 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SS18Q15532 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SS18Q15532 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SS18Q15532 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SS18Q15532 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SS18Q15532 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SS18Q15532 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SS18Q15532 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SS18Q15532 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SS18Q15532 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SS18Q15532 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SS18Q15532 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SS18Q15532 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SS18Q15532 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SS18Q15532 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SS18Q15532 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SS18Q15532 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SS18Q15532 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SS18Q15532 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SS18Q15532 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SS18Q15532 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SS18Q15532 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SS18Q15532 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SS18Q15532 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SS18Q15532 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SS18Q15532 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SS18Q15532 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SS18Q15532 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SS18Q15532 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SS18Q15532 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SS18Q15532 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SS18Q15532 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SS18Q15532 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SS18Q15532 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SS18Q15532 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SS18Q15532 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SS18Q15532 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SS18Q15532 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SS18Q15532 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SS18Q15532 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SS18Q15532 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SS18Q15532 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SS18Q15532 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms