Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

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Length 398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYTH1Q15438 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
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