Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TLR1Q15399 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms